Imagerie par Resonance Magnetique Functionnelle (fMRI en anglais)

Developing Intelligence fait le point sur les problemes inherents a l'utilisation de fMRI pour les etudes du cerveau:

1- Si 2 groupes different dans l'utilisation de leur cerveau pour une meme tache, cela peut provenir de differences de comportement des 2 groupes.
Ex: les moins ages peuvent requerir une activite dans plus de zones de leur cerveau pour effectuer une tache car ils n'ont pas encore appris a optimiser le processus pour la tache en question. Les zones du cerveau ont la meme fonction dans tous les groupes mais c'est seulement le processus pour realiser la tache qui n'utilise pas les memes ressources.

2- considerer l'influence du scanner sur le comportement des patients! Le fMRI est une grosse machine reduisant considerablement les mouvements (a eviter pour les claustrophobes) et faisant un bruit metallique sourd periodiquement.

3- comment trouver une reference commune a 2 groupes pour evaluer les differences dans l'execution d'une tache? Afin de pallier aux problemes precedents, on utilise une tache de base commune aux 2 groupes et verifie les differences d'activite entre la tache de base et la tache mesuree dans chaque groupe. Le probleme toutefois est de mesurer les differences dans l'execution de la tache de base entre les 2 groupes.

4- Le probleme de l'inhibition d'une zone qui est necessairee pour l'accomplissement d'une tache mais qui n'est pas prise en compte forcement dans les mesures d'activite.

algebre lineaire

Definitions simples, voire un peu d'intuition pour quelques termes d'algebre lineaire..

- eigenvalue, eigenvector, eigenspace (valeur propre, vecteur propre, espace? propre), d'apres Wikipedia:
Une matrice peut agir sur un vecteur en changeant sa longueur et direction. Toutefois pour certains vecteurs, la matrice ne changera que leur longueur. Ces vecteurs sont les vecteurs propres de la matrice.
Le facteur qui multiplie la longueur initiale du vecteur propre est appele la valeur propre associee.
Tous les vecteurs propres qui ont la meme valeur propre + le vecteur nul forment l'espace(?) propre.
matrice M, vecteur v, variable l  -->  Mv = lv

- trace d'une matrice:
somme des elements de la diagonale principale (haut gauche vers bas droite) de la matrice.

a suivre...

Changement de repere 3D

Voici les sources d'un petit programme pour calculer les coordonnees
d'un point 3D d'un systeme de coordonnee a un autre:

// a: double[3]: angles de rotation du 2eme repere par rapport au premier
// t: double[3]: translation du 2eme repere par rapport au premier
// p: double[3]: coordonnees du point
// repereMonde: repere dans lequel les coordonnees du point sont
exprimees = true -> repere monde, false -> 2eme repere
// np: double[3]: coordonnees calculees (output)

void ccs( double *a, double *t, double *p, bool repereMonde, double *np )
{
// calcul la matrice de transformation
double mat[16];
double cax = cos ( a[0] );
double cay = cos ( a[1] );
double caz = cos ( a[2] );
double sax = sin ( a[0] );
double say = sin ( a[1] );
double saz = sin ( a[2] );

// matrice est calculee facon OpenGL..
mat[0] = caz * cay;
mat[1] = saz * cay;
mat[2] = -say;
mat[3] = 0;

mat[4] = caz*say*sax-saz*cax;
mat[5] = saz*say*sax+caz*cax;
mat[6] = cay*sax;
mat[7] = 0;

mat[8] = caz*say*cax+saz*sax;
mat[9] = saz*say*cax-caz*sax;
mat[10] = cay * cax;
mat[11] = 0;

mat[12] = t[0];
mat[13] = t[1];
mat[14] = t[2];
mat[15] = 1;

if( repereMonde ) {
double tnp[3];
tnp[0] = p[0]-mat[12];
tnp[1] = p[1]-mat[13];
tnp[2] = p[2]-mat[14];
np[0] = mat[0]*tnp[0] + mat[1]*tnp[1] + mat[2]*tnp[2];
np[1] = mat[4]*tnp[0] + mat[5]*tnp[1] + mat[6]*tnp[2];
np[2] = mat[8]*tnp[0] + mat[9]*tnp[1] + mat[10]*tnp[2];
} else {
np[0] = mat[0]*p[0] + mat[4]*p[1] + mat[8]*p[2] + mat[12];
np[1] = mat[1]*p[0] + mat[5]*p[1] + mat[9]*p[2] + mat[13];
np[2] = mat[2]*p[0] + mat[6]*p[1] + mat[10]*p[2] + mat[14];
}
}

Je n'ai fait que quelques tests basiques donc il n'est pas impossible
qu'il y ait des erreurs planquees.

Attention: Il y a des problemes de precision donc il vaut mieux eviter
de faire beaucoup de transformations a la suite.